大巨蛋案持續僵持中，但在日前卻傳出，北市府已通過遠雄的樹木移植計畫，準備在本（5）月對大巨蛋周遭老樹進行斷根，今年（2017）11月到明年（2018）1月進行移植。為此，護樹團體今日（5/2）前往北市府大門前抗議，除了要求市府立即指定光復南路數顆樹齡已達50歲的老樹為受保護樹木外，更批評市長柯文哲上任前曾參與護樹，但執政後卻態度驟變，成為財團砍樹的幫兇。
松菸公園催生聯盟游藝拿出市府內部的會議資料，資料顯示這次樹木移植計畫，是由遠雄向台北市體育署提出，最後卻由市長室派專員主持並進行。游藝批評，該決議過程中，市府從未與護樹團體討論，擅自就做出移樹的決定，完全違背柯文哲所說的「開放政府」，徹底的黑箱作業，讓人無法再信任。
在柯文哲尚未上任前，2014年4月起護樹團體即開始護樹運動，時為醫師的柯文哲也曾參與護樹行動。當時柯文哲表示，「如果，我們不能把樹當作樹看待，把樹當作一個生命體看待的話，我們如何建立一個把人當作人看待的社會?我認為，這樣處理老樹的方法, 不是一個文明城市應該有的行為。」
而時至今日，柯文哲卻成為護樹團體的質疑對象，對此，柯文哲於中午受媒體詢問時僅表示，「絕對不會亂砍樹，一切都按照SOP進行，斷根什麼的都照規定進行」。而當本社記者向體育署詢問更多細節時，體育署新聞室也僅表示，「由於柯文哲市長已經公開回應媒體，爲統一口徑，就不再回應相關訊息」；不願透漏更多樹木移植計畫的細節。
根據護樹團體得到的訊息，大巨蛋周遭的33顆行道樹將在今年5月到7月進行斷根作業，並在今年11月起開始移植，未來將移植到位於南港的流行音樂中心。遠雄聲稱，移樹工程的存活率應達百分之百。
游藝批評，就算遠雄宣稱將讓樹木百分之百存活，但斷根、移植作業就是會對樹木造成傷害，而其中的「必要性」何在？ 他說，北市府與遠雄應早日給出答案，過程中若市府仍執意傷害樹木，護樹團體也會抗爭到底，「下次可不是喊喊口號就算了」。